Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAD23AP54725 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAD23AP54725 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms