Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms