Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms