Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VEGFBP49765 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms