Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP5P45974 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP5P45974 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP5P45974 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP5P45974 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP5P45974 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms