Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TGFBR1P36897 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms