Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-FP30511 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-FP30511 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms