Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms