Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRMP28827 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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