Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms