Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KDELR1P24390 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms