Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATF3P18847 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATF3P18847 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATF3P18847 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms