Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB9P17482 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms