Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFTRP13569 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CFTRP13569 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms