Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms