Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms