Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms