Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNC1O60486 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms