Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms