Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms