Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms