Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
REREQ9P2R6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms