Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms