Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms