Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms