Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf72Q96LT7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms