Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms