Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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