Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BORCS6Q96GS4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms