Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms