Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms