Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PBRM1Q86U86 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms