Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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