Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms