Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4L3Q6VB84 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXD4L3Q6VB84 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms