Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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MED27Q6P2C8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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MED27Q6P2C8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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MED27Q6P2C8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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