Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms