Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms