Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms