Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR44Q5JSH3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms