Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C3orf38Q5JPI3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms