Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms