Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms