Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms