Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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