Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms