Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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