Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms