Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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