Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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